本发明提供一种酶法水解定向制备褐藻胶寡糖的方法,其中使用的褐藻胶裂解酶,其氨基酸序列为SEQ ID NO:3。本发明利用基因改造的重组褐藻胶裂解酶,定问制备褐藻胶寡糖,与现有酸法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比,克服了破坏性大、效率低的缺点，与现有的酶法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比，运用改造的重组褐藻胶裂解酶,克服了酶解时间长、成本高、不能定问制备特定聚合度的褐藻胶寡糖的缺点。
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